Jedna od primarnih barijera za liječenje ili razvijanje učinkovitog cjepiva za HIV je visoka genetska raznolikost samog virusa. Dok virusi koji koriste dvolančanu DNK za repliciranje relativno su stabilni, retrovirusi poput HIV-a idu unatrag u ciklusu replikacije (koristeći jednu soju RNA) i daleko su manje stabilni. Kao rezultat toga, HIV je vrlo sklon mutaciji – mutacija, zapravo, oko milijun puta češće od stanica koje koriste DNA.
Budući da se genetska raznolikost virusa širi i različiti virusni podtipovi prenose s osobe na osobu, mješoviti genetički materijal može stvoriti nove HIV hibride. Dok većina tih hibrida umire, nekoliko preživjelih često pokazuju veću otpornost na terapiju HIV-om i, u nekim slučajevima, brže napredovanje bolesti.
Varijabilnost HIV-a stoga stvara nešto od "pokretnog cilja" za istraživače, s novim rekombinantnim (kombiniranim genetskim) sojevima koji su u stanju izdržati ili u potpunosti izbjegavati sredstva za neutralizaciju. Neki, poput soja A3 / 02 koji su utvrdili švedski istraživači 2013. godine, mogu iscrpiti imunosnu obranu osobe daleko agresivnije od prethodno poznatih sojeva.
Što su HIV-1 i HIV-2? Postoje dvije vrste HIV-a: HIV-1 i HIV-2. HIV-1 se smatra dominantnim tipom koji predstavlja veliku većinu infekcija širom svijeta, dok je HIV-2 daleko manje uobičajen i prvenstveno koncentriran u zapadnoj i središnjoj afričkoj regiji. Dok oba ova tipa HIV-a mogu dovesti do AIDS-a, HIV-2 je mnogo teže prenositi i daleko manje virulentan od HIV-1. U svakoj od ovih tipova HIV-a postoji niz skupina, podtipova ("krakova") i podtipovi. Nesumnjivo će se otkriti drugi podtipovi i rekombinantni sojevi kao globalno širenje HIV-a.
HIV-1 grupe i podtipovi
HIV-1 je podijeljen u četiri skupine: Grupa M (što znači "glavni"); Skupina O (što znači "outlier", ili iza toga gdje se vide druge skupine); i Grupa N (što znači "ne-M" i "ne-O"); i skupina P (što znači "na čekanju"). Četiri različite skupine klasificirane su u četiri različita virusa simian imunodeficijencije (SIV) za koje se zna da se prenose od majmuna ili čimpanza do čovjeka.
HIV-1 grupa M
HIV-1 grupa M bila je prva skupina koja se identificira i danas predstavlja oko 90% slučajeva HIV-a širom svijeta i može se naći gotovo u svakom dijelu planeta. Unutar ove skupine postoje 10 podtipova, što može biti stratificirano, između ostalog, njihovom geografskom distribucijom i njihovim utjecajem na različite skupine rizika.
Podvrsta A: vidljiva u Zapadnoj Africi i koja utječe prvenstveno na heteroseksualce i korisnike droga za ubrizgavanje (IDU). Podvrsta B: dominantni podvrsti u Europi, Americi, Japanu, Tajlandu i Australiji, što predstavlja gotovo sve infekcije u Sjevernoj Americi i oko 80% svih u Europi. Infekcije se javljaju u više ljudi koji imaju seksualne odnose s muškarcima (MSM) i IDU-ima od heteroseksualaca. Podvrsta C: opisana je kao najčešći HIV podtip koji predstavlja 48% svih infekcija diljem svijeta, prvenstveno heteroseksualnih i prvenstveno u subsaharskoj Africi, Indiji i dijelovima Kine.
Podtip D: izolirati uglavnom u istočnoj i središnjoj Africi.
Podvrsta E: podtip koji se vidi samo u rekombinantnom obliku podtipka A.
- Podtip F: među manjim postotkom infekcija koje se vide u srednjoj Africi, Južnoj Americi i Europi.
- Podvrsta G: među manjim postotkom infekcija koje se vide u dijelovima Afrike i Europe.
- Podvrsta H: među manjim postotkom infekcija koje se vide u srednjoj Africi.
- Podvrsta J: promatrana u Sjevernoj, Srednjoj i Zapadnoj Africi i Karibima
- Podvrsta K: ograničena na Demokratsku Republiku Kongo (DRC) i Kamerun.
- HIV-1 grupa O
- HIV-1 grupa O otkrivena je 1990. godine i predstavlja samo 1% infekcija širom svijeta.
- Ova HIV skupina je izolirana u Kamerunu i susjednim afričkim zemljama. HIV-1 grupa N
- HIV-1 grupa N otkriveno je 1998., a opet je vidljivo samo u Kamerunu s manje od 20 slučajeva dokumentiranih do danas.
- HIV-1 grupa P
HIV-1 grupa P je rijetka vrsta HIV-a, prvo identificirana u žena iz Kameruna u 2009. godini. Ona se može razlikovati od druge skupine HIV-a ukoliko je njezino porijeklo povezano s oblikom SIV pronađenim u zapadnim gorilama , Iako je klasifikacija "P" trebala zakljuciti status "na čekanju" (tj. Čeka potvrdu dodatne infekcije), drugi je dokumentirani slučaj identificiran 2011. godine u cameronskom čovjeku.
HIV-2 skupine
Iako su slučajevi HIV-2 identificirani negdje drugdje, infekcije se gotovo isključivo vide u Africi. Trenutno ima osam HIV-2 skupina, iako su jedini podtipovi A i B jedini koji se smatraju epidemijom. Vjeruje se da HIV-2 ima prekrižene vrste od vrste SIV koji utječu na
čarobne mangabeys
majmun izravno ljudima. ◆ HIV-2 grupa A uglavnom se vidi u Zapadnoj Africi, iako je međunarodna putovanja dovela do malih pregršt dokumentiranih slučajeva u SAD-u, Europi, Brazilu i Indiji. Nasuprot tome, HIV-2 skupina B ograničena je na dijelove Zapadne Afrike.
