U ljeto 2016., na godišnjem sastanku Američkog društva za mikrobiologiju, znanstvenici su se okupili da dijele i raspravljaju o nalazima vezanim za svijet bakterija i ljudsko zdravlje.
Među otkrićima, skupina je izvijestila o cijelom genomu, ili kompletnom skupu gena, za bakteriju zvanu Paeinbacillus vrsta soja VT 400 (PVT400). Ove bakterije bile su prethodno pronađene u slini dječjeg pacijenta s akutnom limfoblastičnom leukemijom (ALL).
Detaljne informacije iz ove i buduće studije pomoći će znanstvenicima da saznaju mogu li ove bakterije imati ulogu u ljudskoj bolesti, osobito kod osoba s akutnom leukemijom koja uzrokuje upalu pluća ili krvotok infekcije.
Pneumonija kod osoba s rakom
Pneumonija je vodeći uzrok smrti kod pacijenata s rakom s neutropenijom, a posebno onih s akutnom leukemijom. Neutropenija je nizak broj neutrofila u krvi neutrofili su bijele krvne stanice koje su važne za pomaganje tijelu u borbi protiv infekcije.
Infekcije donjih respiratornih sustava vrlo su česte kod bolesnika s rakom, s nekim izvješćima koja pokazuju da 13 do 31 posto bolesnika s leukemijom koje primaju kemoterapiju i do 80 posto primatelja hepatopoietskih transplantiranih matičnih stanica doživjet će najmanje jednu epidemiju upale pluća.
Neutropenska upala pluća potencijalno je životno ugrožavajuće infekcije. U takvim scenarijima liječnici odmah započinju terapiju antibioticima, bez čekanja da laboratorijski rezultati potvrde i odrede vrstu bakterijske infekcije – jer je toliko važno započeti liječenje odjednom kako bi se smanjio rizik da će pacijent podlegnuti infekciji.
U stvari, preventivna terapija se koristi u određenim okolnostima, koje su detaljno opisane u nastavku.
Nedavni napredak u upravljanju neutropeničnom upalom pluća potiču nadu za bolje ishode. Više medicinskih društava izdalo je ažurirane smjernice za antibiotsku terapiju sumnje neutropenične upale pluća.
I moguće je da noviji agensi koji promiču odgovore tijela na infekciju mogu dodatno poboljšati aktivnost antibiotika.
Usredotočivanje na patogene kod pacijenata s neutropenom
Smjernice Američkog društva kliničke onkologije (ASCO) preporučuju liječnicima da spriječe infekciju u ambulantu s dubokom neutropenijom, ali bez groznice. Preporučuje se antibakterijsko i antifungalno liječenje ako se očekuje da će neutrofili ostati ispod 100 μl tijekom više od sedam dana. Smjernica navodi da je poželjno sredstvo za antibakterijsku preventivnu terapiju oralni fluorokinolon, dok je za antifungalnu terapiju oralni triazol.
Pacijenti s neutropenom su osjetljivi na mnogo širi spektar patogena od njihovih kolega. Liječnicima može biti korisno razmotriti odakle dolazi bakterija u predviđanju koji će antibiotici vjerojatno biti otporni i stoga koje će strategije najvjerojatnije biti najučinkovitije.
Paenibacillus vrste
Prema tom cilju, znanstvenici su proučavali PVT400, nove bakterije izolirane od leukemije pacijenta, člana Paenibacillus roda – obitelji štapića oblika bakterijske vrste. Različite vrste unutar ove skupine su izolirane iz tla, vode, biljaka, mlijeka i drugih mjesta.
Međutim, vrsta Paenibacillus nije poznata kao uzročnik ljudske bolesti … sve dok nedavna izvješća nisu pokazala moguću uključenost tri različite vrste Paenibacillus u ljudske bolesti.
Nakon što je PVT 400 izoliran iz sline dječjeg pacijenta s akutnom limfoblastičnom leukemijom, rane su studije pokazale sličnost ovih izolata s vrstama amilolitike, što se nalazi u larve hindgutu leta; Međutim, do danas je ipak istina da P. amylolyticus nije otkriven kod ljudi, a daljnja ispitivanja pokazala su razlike između bakterija sojina-VT 400 pronađenih u pacijentu raka i ostalih P.
amylolyticus sojeva. Tako, kada su istražitelji proučavali cijeli genom VT 400, bilo je mnogo zanimljivih nalaza. Imali su gene koji kodiraju mehanizme otpora kemoterapijskim lijekovima, poput tunicamycina i bleomicina. Također su pronašli gene za bakterijske pumpe povezane s rezistencijom na više lijekova, kao i gene koji kodiraju otpornost na antibiotike, uključujući vankomicin, fosmidomicin, tetraciklin kao i lijekovi slični penicilinu ili beta-laktami.
Autori ove studije genoma zabilježili su da potpuni slijed genoma Paenibacillus sp. soj VT 400 pomoći će odrediti ulogu Paenibacillus vrsta u ljudskim bolestima i pružiti uvid u sastav normalnih bakterija koje žive u bolesnika s rakom krvi.
